28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2268 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3155  hypothetical protein  98.57 
 
 
349 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000300414  hitchhiker  0.0000000000395416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2800  hypothetical protein  90.83 
 
 
349 aa  663    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.78052  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2268  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.582934  hitchhiker  0.000000000247351 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2199  hypothetical protein  92.84 
 
 
349 aa  677    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000639622  hitchhiker  0.000000000128788 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1844  hypothetical protein  98.57 
 
 
349 aa  710    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000141733  hitchhiker  0.0000000024539 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1763  hypothetical protein  90.83 
 
 
348 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000197181  hitchhiker  0.00806436 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1522  hypothetical protein  99.43 
 
 
349 aa  717    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1158  hypothetical protein  96.85 
 
 
349 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.53743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1434  hypothetical protein  91.69 
 
 
349 aa  671    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000482166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1767  hypothetical protein  83.95 
 
 
349 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000332816  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2083  protein of unknown function DUF1277  83.09 
 
 
349 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000880511  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2076  hypothetical protein  83.09 
 
 
349 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1174  hypothetical protein  82.18 
 
 
351 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000255184  hitchhiker  0.000000000000402769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1440  hypothetical protein  82.18 
 
 
351 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1266  hypothetical protein  81.32 
 
 
351 aa  577  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00314635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2153  hypothetical protein  53.01 
 
 
329 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000696662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4451  hypothetical protein  53.01 
 
 
329 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000182249  unclonable  0.00000000157695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2477  hypothetical protein  50.72 
 
 
331 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  0.0132225 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2279  hypothetical protein  50.43 
 
 
331 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00859838  hitchhiker  4.1808499999999996e-21 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2253  hypothetical protein  50.29 
 
 
339 aa  343  2.9999999999999997e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215699  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2614  hypothetical protein  48.71 
 
 
329 aa  342  5e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.4112  decreased coverage  0.00553167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01529  predicted protein  83.15 
 
 
192 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.271996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1003  hypothetical protein  79.64 
 
 
168 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.787679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01963  hypothetical protein  29.28 
 
 
323 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1000  hypothetical protein  90.79 
 
 
78 aa  142  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.13479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0881  hypothetical protein  38.98 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0865  hypothetical protein  38.98 
 
 
224 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1446  DNA mismatch repair protein MutS-like  31.15 
 
 
1002 aa  42.7  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.345088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>