27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_R0007a on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_R0007a    100 
 
 
114 bp  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098a    98.25 
 
 
114 bp  210  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007b    98.17 
 
 
114 bp  200  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098ab    96.49 
 
 
114 bp  194  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R00022b    97.12 
 
 
114 bp  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098b    96.23 
 
 
114 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000537705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
119 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
114 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
119 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
119 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  96.36 
 
 
119 bp  85.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  89.09 
 
 
115 bp  54  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 
115 bp  54  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 
115 bp  54  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 
115 bp  54  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 
115 bp  54  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  89.09 
 
 
115 bp  54  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  87.27 
 
 
115 bp  46.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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