27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2098b on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2098b    100 
 
 
114 bp  226  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098ab    100 
 
 
114 bp  119  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007a    96.23 
 
 
114 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2098a    96.23 
 
 
114 bp  89.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0008  5S ribosomal RNA  94.64 
 
 
119 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007b    95.83 
 
 
114 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0007  5S ribosomal RNA  94.64 
 
 
119 bp  79.8  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0063  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0079  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0068  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0079  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
119 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0007  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0528996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0008  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000537705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0020  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0023  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0063  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.455895  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0068  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0022  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
114 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0019  5S ribosomal RNA  94.55 
 
 
119 bp  77.8  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.296052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R00022b    95.35 
 
 
114 bp  69.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SG  1 ribosomal RNA  96.67 
 
 
115 bp  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000030846  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SF  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 
115 bp  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SE  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 
115 bp  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SC  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 
115 bp  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SB  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 
115 bp  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0481886  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SA  5S ribosomal RNA  96.67 
 
 
115 bp  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_Se5SD  5S ribosomal RNA  93.33 
 
 
115 bp  44.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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