20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1029 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1029  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  384  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0294615  decreased coverage  0.00421364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2467  hypothetical protein  85.34 
 
 
189 aa  314  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2640  hypothetical protein  60.37 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1146  hypothetical protein  75 
 
 
110 aa  148  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1145  hypothetical protein  86.57 
 
 
67 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8952  hypothetical protein  41.72 
 
 
192 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.292057  normal  0.503616 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3004  hypothetical protein  36.36 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0157923  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2966  hypothetical protein  36.62 
 
 
171 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000452312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2683  hypothetical protein  36.62 
 
 
171 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2755  hypothetical protein  36.62 
 
 
171 aa  94  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.141041  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2963  hypothetical protein  36.62 
 
 
171 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000003837 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2704  hypothetical protein  37.31 
 
 
171 aa  93.2  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2966  hypothetical protein  35.1 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2274  hypothetical protein  35.66 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0145177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2757  hypothetical protein  36.76 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0546  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.203884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1944  hypothetical protein  32.09 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0567  hypothetical protein  35.42 
 
 
162 aa  77  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1151  hypothetical protein  77.42 
 
 
79 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  29.55 
 
 
864 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>