46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3319 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3319  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0386046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0412  hypothetical protein  61.64 
 
 		 73 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.424195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0402  hypothetical protein  74.63 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4191  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00133258  normal  0.402597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0267  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473431  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0287  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  67  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00115516  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4151  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4033  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3956  protein of unknown function DUF904  64.38 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4058  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.977961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0335  hypothetical protein  64.38 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2991  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0313  hypothetical protein  71.64 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0304  hypothetical protein  67.12 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3640  hypothetical protein  67.12 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.265944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3654  hypothetical protein  63.01 
 
 		 73 aa  51.6  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3836  hypothetical protein  65.75 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1707  hypothetical protein  43.66 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0103  hypothetical protein  40.54 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4111  hypothetical protein  40.54 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0102  hypothetical protein  40.54 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4045  hypothetical protein  35.53 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001752  hypothetical protein  55.56 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000892974  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00720  hypothetical protein  37.84 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3801  protein of unknown function DUF904  34.62 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4796  hypothetical protein  37.84 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000154448 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2259  hypothetical protein  37.18 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0188652  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0110  protein of unknown function DUF904  36.49 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.470283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3297  hypothetical protein  40.3 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.816011  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4417  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4419  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4304  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4334  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.057731  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4487  hypothetical protein  34.21 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4057  protein of unknown function DUF904  32.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03813  hypothetical protein  32.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03762  hypothetical protein  32.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5383  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4410  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0740873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4160  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4368  hypothetical protein  32.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494436 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4090  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4463  hypothetical protein  32.89 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.495871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0162  hypothetical protein  36.49 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0176  protein of unknown function DUF904  36.49 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0288  hypothetical protein  39.19 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>