31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4487 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4487  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4334  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.057731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4304  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4419  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4417  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  150  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03813  hypothetical protein  94.94 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03762  hypothetical protein  94.94 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4368  hypothetical protein  94.94 
 
 		 81 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.494436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4057  protein of unknown function DUF904  94.94 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5383  hypothetical protein  94.94 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4410  hypothetical protein  94.94 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0740873  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4090  hypothetical protein  94.94 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4463  hypothetical protein  94.94 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.495871  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4160  hypothetical protein  94.94 
 
 		 79 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4045  hypothetical protein  86.08 
 
 		 79 aa  130  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0176  protein of unknown function DUF904  77.22 
 
 		 79 aa  115  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0162  hypothetical protein  77.22 
 
 		 79 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0102  hypothetical protein  77.22 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4111  hypothetical protein  77.22 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208856  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0103  hypothetical protein  77.22 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4796  hypothetical protein  74.68 
 
 		 79 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000154448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0110  protein of unknown function DUF904  74.68 
 
 		 80 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.470283  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3801  protein of unknown function DUF904  69.62 
 
 		 80 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0288  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00720  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2259  hypothetical protein  53.16 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0188652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001752  hypothetical protein  54.43 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000892974  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1707  hypothetical protein  48.1 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3297  hypothetical protein  46.84 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.816011  normal  0.327307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2991  hypothetical protein  41.77 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0412  hypothetical protein  34.21 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.424195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>