17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1307 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1307  hypothetical protein  100 
 
 		 39 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0327387  normal  0.0990052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2410  hypothetical protein  71.79 
 
 		 39 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1505  hypothetical protein  69.23 
 
 		 39 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0108497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2384  hypothetical protein  69.23 
 
 		 39 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123801  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1790  hypothetical protein  64.1 
 
 		 39 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.366851  hitchhiker  0.00000715964 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2010  hypothetical protein  77.14 
 
 		 40 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2577  hypothetical protein  77.14 
 
 		 40 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000600425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1766  hypothetical protein  77.14 
 
 		 40 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000878224  hitchhiker  0.0042759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2618  hypothetical protein  77.14 
 
 		 40 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2693  hypothetical protein  77.14 
 
 		 40 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000672576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2257  hypothetical protein  74.29 
 
 		 40 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074834  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2329  hypothetical protein  74.29 
 
 		 40 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000111896  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002882  hypothetical protein  58.82 
 
 		 43 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03090  hypothetical protein  55.88 
 
 		 43 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2238  hypothetical protein  61.54 
 
 		 40 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000125392  hitchhiker  0.000659162 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0569  hypothetical protein  52.94 
 
 		 43 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000256902  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0895  hypothetical protein  50 
 
 		 38 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0364046  normal  0.679444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>