18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2238 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2238  hypothetical protein  100 
 
 		 40 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000125392  hitchhiker  0.000659162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2577  hypothetical protein  81.58 
 
 		 40 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000600425  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1766  hypothetical protein  81.58 
 
 		 40 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000878224  hitchhiker  0.0042759 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2618  hypothetical protein  81.58 
 
 		 40 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000018451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2693  hypothetical protein  81.58 
 
 		 40 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000672576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1505  hypothetical protein  76.92 
 
 		 39 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0108497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2257  hypothetical protein  76.32 
 
 		 40 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074834  normal  0.461351 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2329  hypothetical protein  76.32 
 
 		 40 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000111896  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2010  hypothetical protein  73.68 
 
 		 40 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2410  hypothetical protein  71.79 
 
 		 39 aa  62.8  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1790  hypothetical protein  69.23 
 
 		 39 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.366851  hitchhiker  0.00000715964 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2384  hypothetical protein  64.1 
 
 		 39 aa  58.2  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123801  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002882  hypothetical protein  55.56 
 
 		 43 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.454619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03090  hypothetical protein  52.78 
 
 		 43 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0569  hypothetical protein  55.56 
 
 		 43 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000256902  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2305  hypothetical protein  78.95 
 
 		 40 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2855  hypothetical protein  74.36 
 
 		 39 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.458842  hitchhiker  0.000000211489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0895  hypothetical protein  55.56 
 
 		 38 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0364046  normal  0.679444 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>