16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2603 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2603  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2534  hypothetical protein  30.33 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5192  hypothetical protein  28.84 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461335  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1426  hypothetical protein  52.86 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1985  hypothetical protein  42.37 
 
 
212 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2438  hypothetical protein  42.11 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.377514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2240  hypothetical protein  35.24 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1201  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1645  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.682807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0307  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.630758  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1903  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0845396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1916  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0853  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2068  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0161763  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2052  hypothetical protein  36.71 
 
 
233 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.55944  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0900  hypothetical protein  19.57 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.171597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>