10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0423 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0423  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0795048  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2191  hypothetical protein  92.25 
 
 		 142 aa  271  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5183  hypothetical protein  73.95 
 
 		 130 aa  191  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2656  hypothetical protein  74.31 
 
 		 121 aa  176  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.200024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0728  hypothetical protein  71.56 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3166  hypothetical protein  70.27 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.102236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7341  hypothetical protein  59.05 
 
 		 136 aa  133  9e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4001  hypothetical protein  57.41 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.912458  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3692  hypothetical protein  56.48 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3455  hypothetical protein  42.86 
 
 		 225 aa  93.2  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>