10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4001 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4001  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  316  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.912458  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3692  hypothetical protein  94.77 
 
 		 153 aa  306  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3166  hypothetical protein  66.35 
 
 		 126 aa  143  8.000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.102236  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7341  hypothetical protein  60.95 
 
 		 136 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0728  hypothetical protein  65.38 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.097299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2656  hypothetical protein  60.75 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.200024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2191  hypothetical protein  50 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5183  hypothetical protein  50.77 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.30118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0423  hypothetical protein  57.41 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0795048  normal  0.351834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>