17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2532 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2532  yycH protein  100 
 
 
445 aa  919    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0020  hypothetical protein  70.11 
 
 
444 aa  671    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0020  hypothetical protein  69.39 
 
 
392 aa  589  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4004  YycH family protein  24.19 
 
 
446 aa  108  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.930687  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5257  YycH family protein  23.09 
 
 
443 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3536  YycH family protein  20.44 
 
 
442 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3407  YycH family protein  20.26 
 
 
449 aa  95.5  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5145  hypothetical protein  20.9 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5713  hypothetical protein  20.9 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5317  YycH protein  20.9 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5570  YycH protein  20.9 
 
 
440 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35171e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5613  YycH protein  21.16 
 
 
440 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5648  YycH protein  21.16 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5348  YycH protein  22.82 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000246614  hitchhiker  0.0000000000000557991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5587  YycH protein  21.9 
 
 
438 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.825694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5161  hypothetical protein  20.98 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0021  YycH family protein  19.82 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
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