17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0021 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0021  YycH family protein  100 
 
 		 431 aa  892    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1948  hypothetical protein  23.76 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.919018  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0066  hypothetical protein  25.18 
 
 		 474 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3536  YycH family protein  23.08 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3407  YycH family protein  22.77 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5257  YycH family protein  21.38 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5648  YycH protein  23.85 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5713  hypothetical protein  23.96 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5145  hypothetical protein  23.96 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5317  YycH protein  23.96 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5570  YycH protein  23.96 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35171e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5161  hypothetical protein  24.48 
 
 		 438 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5613  YycH protein  23.62 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5348  YycH protein  23.49 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000246614  hitchhiker  0.0000000000000557991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5587  YycH protein  23.04 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.825694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4004  YycH family protein  23.33 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.930687  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2532  yycH protein  19.82 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>