20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1299 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1299  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  326  8e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.517112  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1794  hypothetical protein  93.25 
 
 
163 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1829  hypothetical protein  93.25 
 
 
163 aa  264  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0444  hypothetical protein  45.11 
 
 
170 aa  107  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3345  hypothetical protein  45.11 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.303189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4794  hypothetical protein  45.11 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4510  hypothetical protein  44.36 
 
 
169 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4818  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4578  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4413  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4431  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4932  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4798  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4814  hypothetical protein  44.36 
 
 
170 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2737  protein of unknown function DUF948  36.69 
 
 
149 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0694  protein of unknown function DUF948  28.36 
 
 
137 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0433  methyl-accepting chemotaxis-like protein  38.61 
 
 
143 aa  67  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000756521  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0547  hypothetical protein  28.78 
 
 
146 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0738  hypothetical protein  25.55 
 
 
132 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.70209  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1723  methyl-accepting chemotaxis-like protein  34.34 
 
 
130 aa  47.4  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>