44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1075 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1075  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  304  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1605  hypothetical protein  87.59 
 
 
145 aa  275  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1573  hypothetical protein  87.59 
 
 
145 aa  275  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2850  hypothetical protein  71.13 
 
 
144 aa  222  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4176  hypothetical protein  69.72 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4227  hypothetical protein  69.72 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000572414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4061  hypothetical protein  69.72 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432876  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4286  hypothetical protein  69.72 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3907  hypothetical protein  69.72 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4378  hypothetical protein  69.72 
 
 
144 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0969  hypothetical protein  69.01 
 
 
144 aa  218  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4265  hypothetical protein  69.01 
 
 
144 aa  218  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3899  hypothetical protein  69.01 
 
 
144 aa  218  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.46464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3996  hypothetical protein  69.01 
 
 
144 aa  217  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0074486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2292  protein of unknown function DUF1094  65.49 
 
 
143 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000872065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0281  protein of unknown function DUF1094  65.49 
 
 
145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2088  protein of unknown function DUF1094  54.79 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2594  protein of unknown function DUF1094  50.69 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1573  protein of unknown function DUF1094  47.22 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0796151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1618  hypothetical protein  47.92 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03715  hypothetical protein  44.85 
 
 
136 aa  132  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2008  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000251331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2173  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0001109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2316  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1972  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125218  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2179  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1990  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000242123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2019  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000904874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2233  hypothetical protein  45.83 
 
 
144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2196  hypothetical protein  45.14 
 
 
144 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0972  hypothetical protein  43.28 
 
 
135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.291291  normal  0.0903119 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3137  hypothetical protein  45.14 
 
 
144 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000157309  normal  0.0225831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5785  protein of unknown function DUF1094  46.43 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0255597  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0058  protein of unknown function DUF1094  44.12 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6220  protein of unknown function DUF1094  44.53 
 
 
137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0924  hypothetical protein  45.59 
 
 
136 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696142  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3669  protein of unknown function DUF1094  49.26 
 
 
136 aa  122  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0161  protein of unknown function DUF1094  42.03 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000296731  hitchhiker  0.0000000000000231799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1006  hypothetical protein  41.96 
 
 
145 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1517  hypothetical protein  42.66 
 
 
145 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1488  hypothetical protein  42.66 
 
 
145 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.365376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1880  hypothetical protein  40.88 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34977  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1005  hypothetical protein  35.71 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1120  protein of unknown function DUF1094  44.2 
 
 
171 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>