44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1006 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1006  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  305  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1517  hypothetical protein  79.31 
 
 
145 aa  247  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1488  hypothetical protein  79.31 
 
 
145 aa  247  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.365376  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1573  protein of unknown function DUF1094  54.55 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0796151  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2594  protein of unknown function DUF1094  55.24 
 
 
145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2316  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2179  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2196  hypothetical protein  52.08 
 
 
144 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1972  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  154  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000125218  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2173  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0001109  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2019  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000904874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1990  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000242123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2008  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  154  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000251331  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1618  hypothetical protein  51.39 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3137  hypothetical protein  50.69 
 
 
144 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000157309  normal  0.0225831 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2233  hypothetical protein  50.69 
 
 
144 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5785  protein of unknown function DUF1094  50.36 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0255597  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0161  protein of unknown function DUF1094  48.92 
 
 
143 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000296731  hitchhiker  0.0000000000000231799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6220  protein of unknown function DUF1094  47.48 
 
 
137 aa  124  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2088  protein of unknown function DUF1094  49.29 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0058  protein of unknown function DUF1094  48.2 
 
 
136 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.231212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1605  hypothetical protein  44.06 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1573  hypothetical protein  44.06 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0972  hypothetical protein  45.99 
 
 
135 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.291291  normal  0.0903119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03715  hypothetical protein  48.92 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.305052  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0924  hypothetical protein  47.48 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.696142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1075  hypothetical protein  41.96 
 
 
145 aa  117  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3996  hypothetical protein  41.1 
 
 
144 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0074486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2850  hypothetical protein  41.1 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0969  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4227  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000572414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4061  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3899  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.46464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3907  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4378  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4176  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618694 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4286  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000430478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4265  hypothetical protein  40.41 
 
 
144 aa  114  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2292  protein of unknown function DUF1094  46.32 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000872065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0281  protein of unknown function DUF1094  44.53 
 
 
145 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1005  hypothetical protein  40.29 
 
 
166 aa  106  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3669  protein of unknown function DUF1094  48.92 
 
 
136 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1880  hypothetical protein  42.75 
 
 
145 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34977  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1120  protein of unknown function DUF1094  45.32 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>