35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0916 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0916  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  9e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.540583  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1433  hypothetical protein  82.39 
 
 		 155 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.334594  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1406  hypothetical protein  82.39 
 
 		 155 aa  242  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.030879  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2316  hypothetical protein  54.19 
 
 		 168 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000190986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1549  ccdC protein  54.19 
 
 		 168 aa  163  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000554565  normal  0.0124561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3702  ccdC protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3726  hypothetical protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3366  cyotchrome c defective protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.227396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3416  cyotchrome c defective protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3678  ccdC protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3454  ccdC protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3694  ccdC protein  54.19 
 
 		 168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3767  ccdC protein  53.55 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3347  hypothetical protein  52.9 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000560261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1249  protein of unknown function DUF1453  51.01 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2006  CcdC protein  52.29 
 
 		 159 aa  155  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000296528  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1899  CcdC protein  51.02 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120235  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3439  CcdC protein  51.02 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.724105  hitchhiker  0.00000000000489443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1980  ccdC protein  50.33 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00975865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1757  hypothetical protein  48.37 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000313443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2130  protein of unknown function DUF1453  51.05 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0344  protein of unknown function DUF1453  40.14 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2952  CcdC protein  29.85 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2631  CcdC protein  30 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2905  CcdC protein  30 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000582748 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2942  ccdc protein  29.1 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000671484  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2709  CcdC protein  30 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.436512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2327  CcdC protein  31.3 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.703287  hitchhiker  0.0000243911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2654  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000477823  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5363  CcdC protein  32.38 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3678  CcdC protein  30.61 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3753  CcdC protein  30.61 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1563  CcdC protein  30.61 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.430512 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1896  hypothetical protein  41.03 
 
 		 49 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1758  hypothetical protein  41.03 
 
 		 49 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>