38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1249 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1249  protein of unknown function DUF1453  100 
 
 
160 aa  315  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2130  protein of unknown function DUF1453  79.87 
 
 
157 aa  258  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3347  hypothetical protein  61.84 
 
 
168 aa  197  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000560261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3694  ccdC protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3678  ccdC protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3454  ccdC protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3767  ccdC protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0118703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3416  cyotchrome c defective protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3702  ccdC protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3366  cyotchrome c defective protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.227396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3726  hypothetical protein  61.18 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2316  hypothetical protein  61.18 
 
 
168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000190986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2006  CcdC protein  62.09 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000296528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1549  ccdC protein  60.53 
 
 
168 aa  194  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000554565  normal  0.0124561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1757  hypothetical protein  62.09 
 
 
160 aa  193  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000313443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1980  ccdC protein  60.78 
 
 
159 aa  192  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00975865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3439  CcdC protein  58.82 
 
 
159 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.724105  hitchhiker  0.00000000000489443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1899  CcdC protein  58.17 
 
 
159 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1406  hypothetical protein  55.07 
 
 
155 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.030879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1433  hypothetical protein  55.07 
 
 
155 aa  156  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.334594  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0916  hypothetical protein  51.01 
 
 
155 aa  147  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.540583  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0344  protein of unknown function DUF1453  45.33 
 
 
171 aa  142  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2942  ccdc protein  34.42 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000671484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2952  CcdC protein  32.7 
 
 
159 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2905  CcdC protein  33.33 
 
 
159 aa  87  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000582748 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2631  CcdC protein  33.33 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.136723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2709  CcdC protein  33.33 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.436512  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2327  CcdC protein  33.55 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.703287  hitchhiker  0.0000243911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2654  hypothetical protein  33.33 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000477823  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1707  hypothetical protein  50.85 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000164178  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1758  hypothetical protein  59.52 
 
 
49 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1896  hypothetical protein  59.52 
 
 
49 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1736  CcdC protein  47.46 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00160732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3678  CcdC protein  31.62 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.15607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1563  CcdC protein  30.88 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.430512 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3753  CcdC protein  30.37 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5363  CcdC protein  29.7 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1931  hypothetical protein  46.15 
 
 
49 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.116469999999999e-49 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>