17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5313 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5313  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0965662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1701  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.854319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2687  hypothetical protein  68.39 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.493395  normal  0.468955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1504  hypothetical protein  68.59 
 
 		 198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.552555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0146  hypothetical protein  38.99 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  32.39 
 
 		 140 aa  44.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  29.85 
 
 		 142 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1058  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1217  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1294  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.139623  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1139  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0869557  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1036  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1038  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1242  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  32.5 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1190  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0227166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4151  hypothetical protein  29.29 
 
 		 197 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.191021  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>