14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2654 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39620  hypothetical protein  64.76 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3361  hypothetical protein  63.46 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00221996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2683  hypothetical protein  52.48 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.828322  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2259  hypothetical protein  39.22 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000118561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1158  hypothetical protein  40.57 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0800  hypothetical protein  35.92 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0041  hypothetical protein  38.32 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00636964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1556  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2339  hypothetical protein  36.27 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0775  hypothetical protein  33.93 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3672  hypothetical protein  34.82 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1233  hypothetical protein  33.68 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.921092  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1081  hypothetical protein  27.36 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00650626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>