23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0041 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0041  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  225  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00636964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1158  hypothetical protein  68.63 
 
 
111 aa  150  7e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2259  hypothetical protein  54.7 
 
 
119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000118561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0800  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1556  hypothetical protein  55.86 
 
 
108 aa  117  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3672  hypothetical protein  45.79 
 
 
112 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1233  hypothetical protein  45.26 
 
 
112 aa  103  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.921092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0775  hypothetical protein  43.93 
 
 
112 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2339  hypothetical protein  39.25 
 
 
112 aa  97.8  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2683  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  87  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.828322  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1081  hypothetical protein  41.96 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00650626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2654  hypothetical protein  38.32 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39620  hypothetical protein  38.32 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3361  hypothetical protein  38.1 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00221996  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1964  hypothetical protein  31.68 
 
 
105 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0724  hypothetical protein  29 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1724  Protein of unknown function DUF2149  33 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125072  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27460  hypothetical protein  35.19 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0416208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1201  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240997  normal  0.738905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0753  hypothetical protein  29.41 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1478  hypothetical protein  28.85 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3486  hypothetical protein  30.39 
 
 
104 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4503  Protein of unknown function DUF2149  31.68 
 
 
120 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>