17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2944 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2944    100 
 
 		 2900 bp  5749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4172  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  84.43 
 
 		 2919 bp  258  8.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1466  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  85.39 
 
 		 2721 bp  254  1e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2856  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  83.52 
 
 		 2817 bp  238  7.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0241  DNA methylase N-4/N-6  82.21 
 
 		 2820 bp  212  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0200  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  87.68 
 
 		 2691 bp  139  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0550  DNA methyltransferase  89.69 
 
 		 3579 bp  113  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0608509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0939  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  94.44 
 
 		 2655 bp  83.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4081  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  100 
 
 		 3312 bp  79.8  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.178197 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1397  hypothetical protein  84.78 
 
 		 534 bp  71.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2891    95.45 
 
 		 199 bp  71.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4689  hypothetical protein  82.2 
 
 		 726 bp  67.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113346  normal  0.523516 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2831    91.3 
 
 		 111 bp  60  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0787  site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  94.59 
 
 		 1950 bp  58  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0759094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 2022 bp  54  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0237  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  91.89 
 
 		 1881 bp  50.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0580  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  91.89 
 
 		 1890 bp  50.1  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>