9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4983 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2999  peptidase  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4034  Propeptide, PepSY amd peptidase M4 precursor (Tn6048)  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4983  Propeptide, PepSY amd peptidase M4 precursor (Tn6048)  100 
 
 		 111 aa  223  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582955  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2504  propeptide, PepSY amd peptidase M4  82.88 
 
 		 111 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2110  hypothetical protein  82.88 
 
 		 111 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2303  hypothetical protein  87.76 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1041  hypothetical protein  66.2 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0918  hypothetical protein  63.38 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  30.51 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>