21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2166 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2166  hypothetical protein  100 
 
 		 419 aa  864    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3157  hypothetical protein  44.37 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5211  hypothetical protein  44.37 
 
 		 428 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5066  hypothetical protein  47.68 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0663  hypothetical protein  37.97 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4813  hypothetical protein  38.33 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4248  hypothetical protein  34.83 
 
 		 434 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  decreased coverage  0.000181911 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6141  hypothetical protein  36.12 
 
 		 435 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2312  hypothetical protein  35.49 
 
 		 439 aa  206  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0938  hypothetical protein  36.42 
 
 		 455 aa  180  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1470  hypothetical protein  37.08 
 
 		 455 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0902168  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2209  hypothetical protein  37.39 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2879  hypothetical protein  34.38 
 
 		 454 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1108  PP-loop superfamily ATPase-like protein  32.16 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3026  hypothetical protein  30.94 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.182081  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1935  hypothetical protein  28.53 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0264  hypothetical protein  28.62 
 
 		 452 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3225  hypothetical protein  29.34 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1806  hypothetical protein  26.73 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216728  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0069  exsB protein  28.57 
 
 		 229 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.955333 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0068  exsB protein  28.57 
 
 		 229 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>