49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1659 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1659  addiction module toxin Txe/YoeB  100 
 
 		 36 aa  77.4  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5408  addiction module antitoxin  72.73 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4766  addiction module antitoxin  67.65 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0843  addiction module toxin, Txe/YoeB  69.7 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3488  addiction module toxin, Txe/YoeB  69.7 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4878  addiction module antitoxin  69.7 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  66.67 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3815  hypothetical protein  66.67 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264023 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0555  toxin  66.67 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1401  addiction module antitoxin  63.64 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  72.73 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  72.73 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1207  addiction module toxin, Txe/YoeB  65.71 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.927774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2447  addiction module antitoxin  63.64 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0412  addiction module toxin, Txe/YoeB family  69.7 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0575  addiction module toxin, Txe/YoeB family  69.7 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  61.11 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1307  addiction module toxin, Txe/YoeB  66.67 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2605  addiction module toxin, Txe/YoeB family  61.76 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.564887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0662  hypothetical protein  58.33 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0737  hypothetical protein  60.61 
 
 		 88 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000370913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  60.61 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0756561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  54.55 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  54.55 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.58 
 
 		 233 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4635  addiction module toxin, Txe/YoeB  57.58 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242001  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01340  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  55.88 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0336  hypothetical protein  57.58 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.689811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1523  addiction module toxin, Txe/YoeB family  47.22 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.370643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0432  hypothetical protein  51.52 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4433  addiction module antitoxin  60.61 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.322385  normal  0.385628 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2091  RelE  55.88 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.347779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2308  toxin YoeB  57.58 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1640  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.58 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0526904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1215  toxin YoeB  57.58 
 
 		 84 aa  43.5  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0391  addiction module toxin, Txe/YoeB family  54.55 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0392  hypothetical protein  58.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0040336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2721  addiction module antitoxin  54.55 
 
 		 62 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284593  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2479  addiction module antitoxin  48.48 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  51.52 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3893  addiction module toxin, Txe/YoeB family  54.55 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1844  hypothetical protein  54.55 
 
 		 86 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.891967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2537  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.52 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1926  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.52 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3569  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.52 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359061  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  51.43 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  54.55 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  52.94 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2155  addiction module toxin component YoeB  54.55 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>