64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0332 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
162 aa  341  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.498296 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6166  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
159 aa  204  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.126651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5706  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.38 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182474  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0960  glyoxalase family protein family  59.75 
 
 
168 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2265  hypothetical protein  59.29 
 
 
151 aa  186  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.715595  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1822  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 
160 aa  186  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3578  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.94 
 
 
162 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.740518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0455  glyoxalase family protein family  67.72 
 
 
159 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0956574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2515  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.36 
 
 
161 aa  184  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal  0.0126588 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0912  hypothetical protein  66.93 
 
 
159 aa  183  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2036  glyoxalase family protein  66.93 
 
 
159 aa  183  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1941  glyoxalase family protein  66.93 
 
 
159 aa  183  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1881  glyoxalase family protein  66.93 
 
 
159 aa  183  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.966577  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0559  hypothetical protein  66.93 
 
 
159 aa  183  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0323612  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5344  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.75 
 
 
160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3827  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3940  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.984929  normal  0.117628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5764  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.41 
 
 
158 aa  177  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1345  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.73 
 
 
161 aa  174  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317046  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1137  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
166 aa  173  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3467  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.47 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0488  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.62 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2346  hypothetical protein  49.04 
 
 
154 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2829  glyoxalase family protein  49.38 
 
 
160 aa  154  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.77 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.423642  normal  0.441606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3120  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.4 
 
 
173 aa  154  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56 
 
 
147 aa  144  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45 
 
 
140 aa  130  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.326037  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2965  lactoylglutathione lyase, glyoxalase family protein  35.03 
 
 
145 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3223  glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.327953  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3198  glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2973  glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  101  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000833367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3209  glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131915  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2900  lactoylglutathione lyase, glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3203  glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2060  glyoxalase family protein  34.39 
 
 
145 aa  100  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2921  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.39 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0045166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3188  glyoxalase family protein  33.76 
 
 
145 aa  97.4  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4826  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.87 
 
 
159 aa  94  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.37864  normal  0.915337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0535  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.13 
 
 
156 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4156  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.04 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1434  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.19 
 
 
161 aa  89  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1653  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.12 
 
 
160 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00264078  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4906  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.21 
 
 
152 aa  88.2  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2234  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.06 
 
 
141 aa  87.8  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.400995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12659  cadmium inducible protein cadI  34.51 
 
 
152 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123527  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2680  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.66 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00951722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4433  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.57 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2327  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
173 aa  84  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.330927 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0564  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.34 
 
 
168 aa  84  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3013  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.21 
 
 
153 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.0139362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3044  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.91747  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2998  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1557  hypothetical protein  31.21 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0324701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0789  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.44 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02000  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  33.05 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3470  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.87 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0346  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.94 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26430  lactoylglutathione lyase-like lyase  27.34 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.258719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0163  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.69 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  27.12 
 
 
287 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3459  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3322  hypothetical protein  39.39 
 
 
104 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>