18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1983 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1983  Chromosome segregation ATPase-like protein  100 
 
 		 1143 aa  2214    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3800  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1106 aa  327  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.562819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3499  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1082 aa  323  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.722152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5518  Chromosome segregation ATPase-like protein  24.89 
 
 		 1100 aa  296  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.89856 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0006  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1102 aa  285  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03365  glutamyl-tRNA synthetase  24.03 
 
 		 1146 aa  234  6e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1005  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1111 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3173  hypothetical protein  30.96 
 
 		 1029 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.927565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0839  ATPase-like protein involved in DNA repair  29.69 
 
 		 1342 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0728604  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1985  hypothetical protein  24.28 
 
 		 848 aa  60.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.554145  normal  0.056385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2314  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1536 aa  59.3  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.424255  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1805  hypothetical protein  23.91 
 
 		 828 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4425  hypothetical protein  23.6 
 
 		 1071 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4404  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1070 aa  55.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4270  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1097 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852371  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0653  ankyrin repeat-containing protein  22.84 
 
 		 4313 aa  49.7  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  19.44 
 
 		 10203 aa  45.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1891  hypothetical protein  18.61 
 
 		 915 aa  45.4  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>