20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2293 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2293  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  498  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2060  conserved hypothetical conserved membrane protein  83.82 
 
 
241 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621981  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1593  hypothetical protein  63.18 
 
 
228 aa  275  3e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.480967  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2279  hypothetical protein  47.48 
 
 
241 aa  228  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0782  hypothetical protein  56.5 
 
 
236 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.880302  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1740  hypothetical protein  54.91 
 
 
236 aa  178  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4101  integral membrane protein-like  38.71 
 
 
264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0384795  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1977  hypothetical protein  38.81 
 
 
235 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.833289  normal  0.194869 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2333  hypothetical protein  36.07 
 
 
236 aa  138  8.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.077596  normal  0.283872 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2254  hypothetical protein  39.57 
 
 
235 aa  135  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.14865  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4903  hypothetical protein  37.32 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.709279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3060  hypothetical protein  33.04 
 
 
224 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2260  hypothetical protein  34.13 
 
 
224 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2312  hypothetical protein  35.53 
 
 
260 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0039  hypothetical protein  40.69 
 
 
237 aa  121  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0271  hypothetical protein  34.43 
 
 
195 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0381  hypothetical protein  36.11 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1686  hypothetical protein  33.01 
 
 
224 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0500113  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1193  hypothetical protein  39.33 
 
 
233 aa  111  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4742  integral membrane protein-like  31.28 
 
 
258 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>