40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2409 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2409  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 		 98 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2219  citrate lyase subunit gamma  63.92 
 
 		 97 aa  120  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1753  citrate lyase subunit gamma  60.82 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.268986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2026  citrate lyase subunit gamma  59.79 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803494  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2321  citrate lyase subunit gamma  61.86 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3374  citrate lyase subunit gamma  57.73 
 
 		 97 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0065  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0063  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0064  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0066  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0064  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.346396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3170  citrate lyase subunit gamma  47.87 
 
 		 102 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0324  citrate lyase subunit gamma  48.45 
 
 		 98 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0723  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.853845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0705  citrate lyase subunit gamma  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0663  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00574  hypothetical protein  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0782  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3946  citrate lyase subunit gamma  51.14 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000495279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3008  citrate lyase acyl carrier protein  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0677  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0636  citrate lyase subunit gamma  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3027  citrate lyase subunit gamma  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0639  citrate lyase subunit gamma  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0668  citrate lyase subunit gamma  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.966565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00585  citrate lyase, acyl carrier (gamma) subunit  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0736  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3861  citrate lyase subunit gamma  51.14 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0531  citrate lyase subunit gamma  43.88 
 
 		 98 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1633  citrate lyase subunit gamma  41.86 
 
 		 87 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0421  citrate lyase subunit gamma  45.92 
 
 		 97 aa  79.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1163  citrate lyase subunit gamma  41.49 
 
 		 101 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.495535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1087  citrate lyase subunit gamma  47.67 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04670  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.53 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4208  citrate lyase subunit gamma  43.33 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000860507  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0022  citrate lyase subunit gamma  39.56 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0339  citrate lyase subunit gamma  40.45 
 
 		 88 aa  67  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1369  citrate lyase acyl carrier protein  38.67 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0968  citrate lyase subunit gamma  34.52 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  33.33 
 
 		 406 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>