40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0639 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3008  citrate lyase acyl carrier protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00574  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0705  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00585  citrate lyase, acyl carrier (gamma) subunit  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0636  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3027  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0639  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.402181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0668  citrate lyase subunit gamma  100 
 
 		 98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.966565  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0531  citrate lyase subunit gamma  96.94 
 
 		 98 aa  193  7e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0736  citrate lyase subunit gamma  90.82 
 
 		 98 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0677  citrate lyase subunit gamma  90.82 
 
 		 98 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0782  citrate lyase subunit gamma  90.82 
 
 		 98 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.69427  normal  0.236826 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0663  citrate lyase subunit gamma  90.82 
 
 		 98 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0723  citrate lyase subunit gamma  90.82 
 
 		 98 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.853845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3170  citrate lyase subunit gamma  63.83 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.420368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0324  citrate lyase subunit gamma  44.68 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0066  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0064  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.346396 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0065  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0064  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0063  citrate lyase subunit gamma  48.94 
 
 		 97 aa  87.8  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2409  citrate lyase subunit gamma  44.9 
 
 		 98 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.161756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1163  citrate lyase subunit gamma  40 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.495535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2321  citrate lyase subunit gamma  43.16 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.778424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3374  citrate lyase subunit gamma  45.74 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.442353 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1753  citrate lyase subunit gamma  42.11 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.268986  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2026  citrate lyase subunit gamma  42.11 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.803494  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2219  citrate lyase subunit gamma  42.11 
 
 		 97 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1633  citrate lyase subunit gamma  42.53 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3861  citrate lyase subunit gamma  43.18 
 
 		 86 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3946  citrate lyase subunit gamma  43.18 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000495279 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04670  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  39.08 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0421  citrate lyase subunit gamma  37.5 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1087  citrate lyase subunit gamma  40.7 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4208  citrate lyase subunit gamma  40.91 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000860507  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0968  citrate lyase subunit gamma  41.46 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0339  citrate lyase subunit gamma  31.25 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1369  citrate lyase acyl carrier protein  34.67 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  31.43 
 
 		 406 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0022  citrate lyase subunit gamma  31.25 
 
 		 105 aa  46.2  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>