17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3035 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3035  metallophosphoesterase  100 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2061  hypothetical protein  83.1 
 
 
216 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0444  metallophosphoesterase  65.38 
 
 
210 aa  259  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0306436  normal  0.212274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4012  hypothetical protein  44.39 
 
 
218 aa  162  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1124  hypothetical protein  32.74 
 
 
225 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0293  metallophosphoesterase  39.51 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0699  phosphoesterase  37.98 
 
 
201 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0919  metallophosphoesterase  41.34 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0649979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2256  metallophosphoesterase  38.55 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.103514  hitchhiker  0.0021497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1270  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.254283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1203  metallophosphoesterase  33.18 
 
 
226 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1744  hypothetical protein  30.33 
 
 
199 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1871  metallophosphoesterase  31.39 
 
 
229 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5569  metallophosphoesterase  31.74 
 
 
183 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000501153  normal  0.028813 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2890  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
221 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3062  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27593  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0932  metallophosphoesterase  24.1 
 
 
213 aa  42.7  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>