14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0955 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0955  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0329499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3911  hypothetical protein  64.08 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3963  hypothetical protein  64.08 
 
 
105 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  hitchhiker  0.000789455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1571  hypothetical protein  42.72 
 
 
101 aa  90.5  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356079  normal  0.0472602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1799  hypothetical protein  40.38 
 
 
103 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0020  hypothetical protein  37 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681343  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3811  hypothetical protein  36 
 
 
107 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0510  hypothetical protein  35.92 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.012362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2645  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.893359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3862  hypothetical protein  36 
 
 
107 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404726  normal  0.96775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0441  hypothetical protein  40.7 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.423124  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1360  hypothetical protein  31.07 
 
 
107 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1426  hypothetical protein  37.5 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3092  hypothetical protein  34.58 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>