18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0225 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0225  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539205  normal  0.932895 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0608  hypothetical protein  81.4 
 
 
279 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0541  hypothetical protein  70.56 
 
 
282 aa  316  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18399  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3927  hypothetical protein  49.13 
 
 
320 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0697  ferric reductase-like protein  40.66 
 
 
227 aa  129  6e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2081  hypothetical protein  40.67 
 
 
227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0157271  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2593  hypothetical protein  32.56 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3005  ferric reductase related transmembrane protein  35.5 
 
 
216 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2127  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.65 
 
 
217 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0999  hypothetical protein  30.36 
 
 
368 aa  77  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.640171  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4426  hypothetical protein  36.43 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2586  putative integral membrane protein  36.11 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  0.236163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1621  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  28 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.375261  normal  0.208979 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3830  ferric reductase domain-containing protein  29.33 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0224842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1181  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  34.74 
 
 
179 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000481962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17080  Ferric reductase like transmembrane component  23.43 
 
 
347 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.507727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3055  hypothetical protein  29.91 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000276547  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4912  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  22.35 
 
 
347 aa  42.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232241  normal  0.606609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>