11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2793 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2793  histone H1 protein  100 
 
 		 200 aa  258  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000367102  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1338  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0525  putative histone H1-like protein  75.86 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0262829  normal  0.81764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3433  putative histone H1-like protein  75.86 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1155  hypothetical protein  85 
 
 		 198 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0115  hypothetical protein  85 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142134  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0500  hypothetical protein  85 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0598  hypothetical protein  85 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133051  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0567  hypothetical protein  85 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506659  decreased coverage  0.0000676045 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0524  hypothetical protein  85 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.655372  normal  0.219338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2636  hypothetical protein  89.47 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>