14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1958 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1958  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  238  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.237084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1781  hypothetical protein  82.3 
 
 		 113 aa  199  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.670787  normal  0.597346 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2105  hypothetical protein  82.3 
 
 		 113 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0449217  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5662  hypothetical protein  73.45 
 
 		 113 aa  178  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.340656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2870  hypothetical protein  71.68 
 
 		 109 aa  173  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.294622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1592  hypothetical protein  71.68 
 
 		 109 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1329  hypothetical protein  65.49 
 
 		 109 aa  158  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2349  hypothetical protein  66.37 
 
 		 109 aa  152  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0973  hypothetical protein  63.72 
 
 		 109 aa  151  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.784027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4237  hypothetical protein  63.72 
 
 		 109 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3106  hypothetical protein  61.06 
 
 		 109 aa  148  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637865 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2923  hypothetical protein  49.56 
 
 		 114 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.373188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4252  hypothetical protein  57.69 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.818671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3518  cupin 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>