16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0841 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  315  3e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  81.33 
 
 
184 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  46.79 
 
 
160 aa  141  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  68.97 
 
 
156 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  53.1 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  61.46 
 
 
162 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  34.07 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  33.77 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  34.18 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  30.19 
 
 
170 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  36.47 
 
 
153 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  34.88 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  36.47 
 
 
154 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  30.67 
 
 
175 aa  43.9  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.248742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>