17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1281 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  53.33 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  50.29 
 
 		 170 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  67.29 
 
 		 164 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  43.65 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.248742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  59.05 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  56 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  41.22 
 
 		 160 aa  87  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  32.69 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  35.52 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  31.86 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  31.79 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  43.56 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  29.56 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3748  hypothetical protein  32.56 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286744  unclonable  0.000000761757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>