15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03189 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03189  putative arylesterase protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2331  GDSL family lipase  63.77 
 
 		 220 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1943  putative arylesterase protein  63.68 
 
 		 230 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2117  methylated-DNA--protein- cysteinemethyltransferase  42.06 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1606  lipolytic protein G-D-S-L family  41.31 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1799  lipolytic protein G-D-S-L family  40.85 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0665958  hitchhiker  0.00101961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0116  GDSL family lipase  36.71 
 
 		 206 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1079  GDSL family lipase  38.14 
 
 		 213 aa  131  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1627  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.8 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.715312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5173  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.44 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5262  GDSL family lipase  37.44 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5554  GDSL family lipase  37.44 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.675429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4475  lipolytic protein  36.7 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.16 
 
 		 375 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  24.88 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>