29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00391 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00391  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1196    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0724219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3614  hypothetical protein  80.28 
 
 		 572 aa  984    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.746292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7091  hypothetical protein  71.85 
 
 		 547 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2656  hypothetical protein  63.74 
 
 		 546 aa  743    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352143  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4691  hypothetical protein  80.28 
 
 		 572 aa  984    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0863049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3172  hypothetical protein  40.89 
 
 		 605 aa  422  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2519  hypothetical protein  40.64 
 
 		 577 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0380  hypothetical protein  33.99 
 
 		 547 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396423  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2156  hypothetical protein  33.21 
 
 		 550 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2246  hypothetical protein  33.4 
 
 		 541 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335198  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1757  hypothetical protein  32.49 
 
 		 575 aa  211  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847722  normal  0.0488675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1310  hypothetical protein  28.96 
 
 		 606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.222369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2624  hypothetical protein  27.84 
 
 		 558 aa  189  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.377848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2245  hypothetical protein  30.38 
 
 		 528 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.898988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2155  hypothetical protein  30 
 
 		 528 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0522768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0200  hypothetical protein  23.81 
 
 		 549 aa  99.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0418162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0239  YdaL  23.66 
 
 		 549 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0211882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0239  hypothetical protein  23.39 
 
 		 549 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.374038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0204  hypothetical protein  24.25 
 
 		 549 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000016319  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5087  hypothetical protein  23.32 
 
 		 549 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224053  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0200  hypothetical protein  23.37 
 
 		 549 aa  88.6  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0213  hypothetical protein  22.97 
 
 		 549 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0013611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0223  hypothetical protein  22.97 
 
 		 549 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0232  hypothetical protein  22.97 
 
 		 549 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0257  hypothetical protein  22.32 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1780  putative lipoprotein  25.73 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1508  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0627  hypothetical protein  26.84 
 
 		 463 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.665154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0639  hypothetical protein  26.84 
 
 		 463 aa  51.6  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0150059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>