27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3172 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2519  hypothetical protein  98.62 
 
 
577 aa  1169    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3172  hypothetical protein  100 
 
 
605 aa  1244    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.11318  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7091  hypothetical protein  41.54 
 
 
547 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3614  hypothetical protein  39.9 
 
 
572 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.746292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4691  hypothetical protein  39.9 
 
 
572 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0863049 
 
 
-
 
NC_003296  RS00391  hypothetical protein  40.89 
 
 
578 aa  422  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0724219  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2656  hypothetical protein  38.37 
 
 
546 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352143  normal  0.335343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2246  hypothetical protein  34.93 
 
 
541 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2156  hypothetical protein  34.93 
 
 
550 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0126394  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0380  hypothetical protein  32.12 
 
 
547 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.396423  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1757  hypothetical protein  31.73 
 
 
575 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847722  normal  0.0488675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1310  hypothetical protein  32.27 
 
 
606 aa  196  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.222369 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2245  hypothetical protein  31.23 
 
 
528 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.898988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2155  hypothetical protein  31.61 
 
 
528 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0522768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2624  hypothetical protein  28.95 
 
 
558 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.377848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0200  hypothetical protein  22.87 
 
 
549 aa  94.4  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0418162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0239  YdaL  24.91 
 
 
549 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0211882  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0239  hypothetical protein  24.32 
 
 
549 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.374038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0204  hypothetical protein  23.25 
 
 
549 aa  90.9  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000016319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0200  hypothetical protein  23.44 
 
 
549 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0223  hypothetical protein  23.3 
 
 
549 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0213  hypothetical protein  23.3 
 
 
549 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0013611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5087  hypothetical protein  21.78 
 
 
549 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00224053  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0232  hypothetical protein  22.92 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0257  hypothetical protein  21.89 
 
 
549 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1508  putative lipoprotein  22.61 
 
 
445 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1780  putative lipoprotein  22.63 
 
 
445 aa  46.2  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>