72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4360 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4360  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 143 aa  293  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00335592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3743  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.01 
 
 		 141 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3695  putative glyoxalase/Bleomycin resistance protein  70.29 
 
 		 141 aa  206  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.38 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.233812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4542  glyoxalase family protein  56.62 
 
 		 145 aa  150  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0401464  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1956  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.35 
 
 		 138 aa  147  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0355287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0982  hypothetical protein  75.61 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.55 
 
 		 138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.1 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.737344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.41 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0659876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2328  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.23 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.680438  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0867  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.07 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00375378  normal  0.0656171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2271  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3345  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.25 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2376  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3567  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.25 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4102  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.1 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0098  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.71 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0128551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1278  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.85 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6751  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1686  hypothetical protein  36.07 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5587  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.23 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2059  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.538567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4457  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.25 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.17 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.238164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1642  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2192  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0194216  hitchhiker  0.00758205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0094  lactoylglutathione lyase protein  30.08 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2697  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.37 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.276561  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4296  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2204  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.251907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0660  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1930  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.61 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3203  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.397338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3153  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3141  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.81 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5280  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.56 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3632  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.62 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1043  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152076  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5010  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.828723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3357  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4520  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.636133  normal  0.83803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5277  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.02 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1233  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4171  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0328  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.56 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0643215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3301  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.85 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3023  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0559181  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5443  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.43 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.43 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4066  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.32661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4602  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.7 
 
 		 116 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53860  hypothetical protein  46.43 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3843  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.32 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4197  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.78 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966696  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4285  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.33 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5495  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.11 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00157513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0080  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.61 
 
 		 117 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767302  normal  0.415982 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0824  glyoxalase family protein  28.07 
 
 		 117 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0879  glyoxalase family protein  28.07 
 
 		 117 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5734  hypothetical protein  36.92 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0632882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2664  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.41 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000389195  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4774  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0554862  normal  0.0386511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3547  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.625968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4715  hypothetical protein  46.43 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2738  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.46 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3521  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2126  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.46 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0820  hypothetical protein  26.83 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.297026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.22 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0943124  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1188  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.09 
 
 		 121 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.249084 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>