82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1207 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1207  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 		 147 aa  297  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.381304 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2342  hypothetical protein  63.19 
 
 		 149 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.349402 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3728  glyoxalase family protein  38.85 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6552  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.57 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2449  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5362  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.75 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4296  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.1 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3011  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.43 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.392689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2052  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.44 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.842309  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2051  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.92 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.622827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.62 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.728322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1252  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.61 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2653  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.61 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1165  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.67 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0390  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.41 
 
 		 145 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0097  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.88 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.530776  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2038  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.71 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4393  glyoxalase/bleomycin resistance protein dioxygenase superfamily protein  38.89 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3047  lactoylglutathione lyase  34.29 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1945  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.869019  hitchhiker  0.00300875 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2656  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.43 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.859771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1719  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.62 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4513  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.14 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0005  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.55 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2027  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.59 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0156  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.14 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1062  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.08 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.697141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.97 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.57 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58620  hypothetical protein  38.4 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4522  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.42 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4182  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1345  hypothetical protein  43.26 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4416  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.68 
 
 		 140 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0225387 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4316  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.91 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610434  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3083  glyoxalase family protein  38.85 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.52 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5393  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.42 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324521  normal  0.554384 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6100  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.97 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1773  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.97 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.243786  normal  0.593439 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1476  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.41 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2771  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.57 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0779  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1215  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.24 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.743705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1708  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.23 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.129026 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2050  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.24 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0859008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2048  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.06 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000879917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1814  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.76 
 
 		 141 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.071852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5132  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146479  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1878  lactoylglutathione lyase  44.71 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2322  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.1 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0279674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3394  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2211  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 		 265 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.392669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3522  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.17 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6284  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0511658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2283  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.2 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0892969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3214  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.65 
 
 		 277 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000855792  normal  0.159914 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3983  hypothetical protein  31.75 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.286993 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7115  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0233  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2036  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.143948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1470  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.22177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3714  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587684  normal  0.324112 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5993  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30 
 
 		 128 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4197  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.86 
 
 		 143 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0019  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0454203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1487  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3711  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4550  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.482382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4846  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.1 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3813  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.34 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2597  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4362  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.06 
 
 		 140 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2651  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.83 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1750  hypothetical protein  32.79 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.634592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2548  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.31 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5397  hypothetical protein  28 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.15934  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5539  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.84 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4242  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.2 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.16 
 
 		 123 aa  40  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.33915  decreased coverage  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4926  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0545441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1372  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.5 
 
 		 169 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.715832  normal  0.807075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>