42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1016 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1016  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.698133  normal  0.349363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5155  hypothetical protein  88.57 
 
 		 72 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.235295  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0904  hypothetical protein  88.24 
 
 		 74 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0889  hypothetical protein  81.16 
 
 		 80 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0923  hypothetical protein  73.13 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0564  hypothetical protein  72.88 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.797125 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2565  hypothetical protein  52.46 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2625  hypothetical protein  46.97 
 
 		 68 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_003296  RS01748  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.428849  normal  0.875882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0699  hypothetical protein  49.21 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0716  hypothetical protein  49.21 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.557058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0787  hypothetical protein  45.31 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0818  hypothetical protein  44.62 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105871  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0335  hypothetical protein  44.62 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3230  hypothetical protein  48.48 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3215  hypothetical protein  48.48 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.552244  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2058  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4530  hypothetical protein  52.83 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7011  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0851  hypothetical protein  48.28 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00441128  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4662  hypothetical protein  52.83 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786258  normal  0.0875465 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1923  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2686  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0854  hypothetical protein  46.97 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3176  hypothetical protein  46.97 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79662  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3911  hypothetical protein  43.94 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0290  hypothetical protein  48.44 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0340  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4536  hypothetical protein  52.73 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000488103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1195  hypothetical protein  56.86 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1322  hypothetical protein  42.37 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7216  hypothetical protein  41.94 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4049  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4219  hypothetical protein  40.62 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0429  hypothetical protein  40.32 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0431187  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1431  hypothetical protein  48.94 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403296  normal  0.668696 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3719  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  0.207016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1305  hypothetical protein  46.81 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0567978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4301  hypothetical protein  59.46 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3816  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.140719  normal  0.253569 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0777  hypothetical protein  36.21 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3423  hypothetical protein  45.1 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5106  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0374324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>