11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3217 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3276  hypothetical protein  81.01 
 
 		 460 aa  669    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3217  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  893    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2193  hypothetical protein  79.96 
 
 		 461 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1105  hypothetical protein  79.12 
 
 		 451 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2424  putative membrane protein of unknown function  80.23 
 
 		 461 aa  660    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3250  hypothetical protein  53.11 
 
 		 431 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718681  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3761  hypothetical protein  55.21 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0660829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3410  hypothetical protein  43.78 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3067  hypothetical protein  42.6 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3794  hypothetical protein  42.34 
 
 		 430 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.081224  normal  0.673092 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3897  hypothetical protein  43.14 
 
 		 443 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.412752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>