11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3250 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3250  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718681  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3761  hypothetical protein  66.51 
 
 
433 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0660829  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3217  hypothetical protein  53.11 
 
 
447 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1105  hypothetical protein  54.09 
 
 
451 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2424  putative membrane protein of unknown function  54.46 
 
 
461 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3276  hypothetical protein  55.27 
 
 
460 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.899645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2193  hypothetical protein  56.63 
 
 
461 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3410  hypothetical protein  46.77 
 
 
438 aa  306  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3067  hypothetical protein  47.15 
 
 
430 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3897  hypothetical protein  47.41 
 
 
443 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.412752 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3794  hypothetical protein  47.15 
 
 
430 aa  300  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.081224  normal  0.673092 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>