12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3190 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3190  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727862  normal  0.383521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3246  hypothetical protein  77.17 
 
 		 92 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2217  hypothetical protein  77.17 
 
 		 92 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.819518  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2449  hypothetical protein  69.57 
 
 		 92 aa  144  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2047  hypothetical protein  63.04 
 
 		 91 aa  124  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0801  hypothetical protein  63.64 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0391557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2893  hypothetical protein  54.35 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12305  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1312  hypothetical protein  39.56 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0221873  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1088  hypothetical protein  37.08 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0429  hypothetical protein  36.36 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000727417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2541  hypothetical protein  36.96 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3236  hypothetical protein  32.56 
 
 		 92 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>