13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3246 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3246  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  189  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2217  hypothetical protein  93.48 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.819518  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2449  hypothetical protein  81.52 
 
 		 92 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3190  hypothetical protein  77.17 
 
 		 92 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.727862  normal  0.383521 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2047  hypothetical protein  64.13 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0801  hypothetical protein  61.11 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0391557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2893  hypothetical protein  55.43 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.12305  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1312  hypothetical protein  39.13 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0221873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0429  hypothetical protein  35.16 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000727417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1088  hypothetical protein  32.94 
 
 		 98 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3516  hypothetical protein  34.88 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2541  hypothetical protein  34.09 
 
 		 109 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3236  hypothetical protein  28.92 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>