17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3074 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3074  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.505278  normal  0.0664218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3609  hypothetical protein  76.83 
 
 		 82 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0201404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2494  putative exported protein of unknown function  86.59 
 
 		 82 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3194  hypothetical protein  82.93 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2547  hypothetical protein  68.29 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.677292  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2147  hypothetical protein  68.29 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2261  hypothetical protein  81.71 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0839  hypothetical protein  62.2 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2310  hypothetical protein  35.62 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2368  hypothetical protein  34.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00768367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2107  hypothetical protein  35.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3015  hypothetical protein  35.62 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.712573 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2446  hypothetical protein  35.62 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.17765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2184  hypothetical protein  34.25 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  33.8 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2343  hypothetical protein  34.25 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2363  hypothetical protein  34.25 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>