18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3609 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3609  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0201404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3074  hypothetical protein  76.83 
 
 
82 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.505278  normal  0.0664218 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2547  hypothetical protein  71.95 
 
 
82 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.677292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2494  putative exported protein of unknown function  71.95 
 
 
82 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3194  hypothetical protein  71.95 
 
 
82 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2147  hypothetical protein  71.95 
 
 
82 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0839  hypothetical protein  64.63 
 
 
83 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2446  hypothetical protein  38.57 
 
 
70 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.17765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2368  hypothetical protein  37.14 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00768367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2151  hypothetical protein  38.57 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.241708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2107  hypothetical protein  37.14 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2121  hypothetical protein  35.71 
 
 
89 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2310  hypothetical protein  35.71 
 
 
70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2261  hypothetical protein  69.51 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.416814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2363  hypothetical protein  34.29 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2343  hypothetical protein  34.29 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2184  hypothetical protein  34.29 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3015  hypothetical protein  34.29 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.712573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>