15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1113 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  7.999999999999999e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.596296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1399  addiction module antitoxin  62.5 
 
 		 96 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.962598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0528  hypothetical protein  60.42 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2630  hypothetical protein  64.21 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0398  hypothetical protein  56.99 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0199  hypothetical protein  53.76 
 
 		 94 aa  98.2  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.483017 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0896  hypothetical protein  48.39 
 
 		 92 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000152682  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02182  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.636046  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4619  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1577  hypothetical protein  44.94 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000158487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0280  hypothetical protein  42.7 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1570  addiction module antitoxin  32.56 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.607928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0373  plasmid stabilization system protein  28.74 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.082375  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4056  plasmid stabilization system  36.11 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0286  hypothetical protein  38.03 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00972364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>